分居三年后，如果夫妻关系未能得以修复，就可以申请离婚。具体申请流程如下：
1. 准备资料：申请离婚需要准备夫妻双方的身份证、结婚证、房产证、车辆证等相关证件，还需要提供离婚协议书和财产分割协议书。
2. 提交申请：将准备好的资料和协议书交到当地的民政局，递交书面离婚申请，并进行办理手续。民政局会登记申请，双方需要签字确认协议内容是否真实有效。
3. 等待裁决：通常情况下，民政局会开展一个调解期，以协助夫妻双方就各项协议进行协商并对其进行审核。如果调解失败，则会将申请提交法院，并经由权威机构对协议进行审核与裁定。审核完成后，法院会对婚姻关系是否真实有效进行确认，并依据协议内容予以裁决。
分居三年后过打算生活，离婚是一种正当合理的选择。但离婚之前，夫妻双方应该尽力协商和解决分歧，在离婚时平等地分割财产，并尽量保护子女的合法权益。
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